病毒检测处于极限浓度(低)该怎么办?

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[日期:2019-10-14] [阅读:2070] [关闭] [返回]


自2019年6月11日,爱基因所代理的北京明日达非洲猪瘟微流控芯片快速检测试剂盒,以灵敏度高、特异性强、可支持现场快检等优点,入选了中国农业农村部发布的第二批非洲猪瘟现场快速检测试剂名单。非洲猪瘟检测试剂盒受到官方的肯定,爱基因依托微流控快速检测平台,迅速的进入了华东、华西、华南、华北、华中与政府部门等有精准检测需求的企事业单位。


非洲猪瘟微流控芯片快速检测试剂盒采用的是核酸恒温扩增技术(EXO-NAT),在微流控的平台上进行核酸扩增。作为一种分子生物学检测技术,具有高特异性、高敏感性、简单、便捷及成本低的特点,已广泛用于临床疾病的诊断、流行性细菌或病毒的定性检测、动物胚胎性别鉴定及基因芯片开发等领域。但是当病毒浓度处于检测仪设定的极限值以下时,就会造成检测无效、检测失败等情况。





影响实验准确性的几个焦点


  • 病毒载量

  • 样本处理方式

  • 操作熟练度



病毒载量

什么是病毒载量?


病毒载量简单的说就是通过测量从而显示单位体积里病毒的数量。


举个例子,我把一头猪放在猪栏里,我能很快找到这头猪。但是我把猪放到猪群里,假设没有特殊的标记我就很难找到这头猪。找这头猪的难度和猪群的数量有关,猪群的数量越大我找到这头猪的难度就越大。病毒载量也是同样的道理,在唾液、血液中和环境等样本,经过核酸提取后,靶向病毒的DNA与各种不同的DNA混合在一起,靶向病毒浓度越低,则找到这个病毒就越难越慢,甚至找不到。


在现实情况中,不同的检测试剂盒对病毒的灵敏度不同,所以不同的检测试剂盒对病毒载量有不同的要求。以检测非洲猪瘟病毒为例,爱基因核酸检测仪配合非洲猪瘟检测试剂盒,检测非洲猪瘟病毒设计的极限浓度是10∧2COPIES/μl。其所代表的意思是在理想的实验环境中,爱基因核酸检测仪能在1μl溶液中检测出含100个病毒拷贝的DNA样本,低于这个标准,就不能保证可以检测出非洲猪瘟病毒核酸。




样本处理


核酸提取是进行核酸恒温扩增的前提条件,样本在上机之前都应进行核酸提取,爱基因推荐的有3种方法:快提法、柱式法、磁珠法。这3种核酸提取各有各的优点,一般来说,磁珠法提取的核酸纯度优于另外两种提取方式,利于病毒的检测的准确性,柱式法次之;快提法以快速、简单、易操作等优点,受到广大操作者的喜爱。


现实情况中,核酸检测往往是交给第三方的检测机构进行检测,则样本需要经历较长时间的运输,可能会导致核酸降解不利于病毒检测。采集或者处理后的样品应在2℃-8℃条件下保存不超过24小时。若长期保存,应放置-70℃冰箱,避免反复冻融(不超过3次)。采集的样品密封后,采用保温壶或保温桶加冰密封,在6小时-8小时之内送到实验室。为保证实验结果的准确性和可靠性请实验室人员应使用已校准的移液器,选用合格的一次性使用的反应管、离心管、枪头等进行样本处理及配液等操作,所有用具应不含DNA酶和RNA酶,然后根据不同的检测要求选择合适的核酸提取方式。



重点因素




处理方法

存储温度






操作熟练度



检测要由经过的专业培训的实验员进行操作。人员操作习惯和熟练度也会对实验的准确性造成影响。核酸检测实验操作步骤众多,用量精确,需要多次更换移液枪枪头,多次添加裂解液、洗脱液、蛋白酶等反应试剂。


实验人员应严格按照说明书进行操作,为了避免样本中任何潜在的生物危险,检测样本应视为具有传染性物质,避免接触到皮肤和黏膜;所用过的试管、吸头需打入盛有消毒剂的容器,并与废物一起灭菌后方可丢弃;试剂盒组分需在效期内使用,不使用试剂盒提供的组分进行实验将可能导致错误结果。